Nach dem Angriff gibt Mark keine Ruhe und beginnt, Jonas zu verfolgen. Gleichzeitig deckt Jonas auf, dass Mark Teil einer größeren Intrige im Unternehmen ist, an der auch mächtige Personen beteiligt sind. Gemeinsam mit Klara schmiedet Jonas einen Plan, um Beweise zu sammeln. Sie installieren heimlich Kameras und dokumentieren Marks kriminelle Handlungen. Doch als Mark ihre Pläne durchschaut, werden Jonas und Klara selbst zum Ziel. In einem dramatischen Moment greifen Sicherheitskräfte rechtzeitig ein und retten die beiden. Parallel dazu durchlebt Anna, eine andere Angestellte, eine schreckliche Zeit. Tobias, ein Mann mit einer krankhaften Besessenheit von ihr, verfolgt sie und übt psychischen Druck aus. Als Anna Tobias endgültig zurückweist, eskaliert die Situation. In einem mutigen Moment konfrontiert Anna Tobias und sagt ihm, dass sie ihn nie geliebt hat und auch nie lieben wird. Ihre Entschlossenheit und das rechtzeitige Eingreifen der Polizei beenden Tobias’ Besessenheit und befreien Anna von seinem Einfluss.
Am Ende gelingt es Jonas und Klara, Mark und die Verantwortlichen hinter der Verschwörung zu entlarven. Anna findet nach all dem psychischen Schmerz zurück zu sich selbst und beginnt, ihr Leben neu zu ordnen. Jonas erkennt, dass Wahrheit und Mut die stärksten Waffen sind, um Herausforderungen zu bewältigen. Die Serie Alles Was Zählt endet mit einer kraftvollen Botschaft: Auch inmitten von Herausforderungen und Gefahren kann man mit Entschlossenheit und Ausdauer jede Hürde überwinden und auf eine bessere Zukunft hoffen.